Como uno de los más importantes instrumentos de apoyo, EMPOPASTO S.A E.S.P, ha implementado el Laboratorio de Control de Calidad del Agua, con el propósito fundamental de realizar análisis Fisicoquímicos y Microbiológicos de Agua Cruda, en Proceso, Tratada y Residual, proporcionando el soporte técnico requerido en las diferentes Áreas de la Empresa. 

Adicionalmente, el Laboratorio ofrece la venta de servicios de análisis de aguas a usuarios externos, tales como comunidades, entes territoriales, sectores productivos, etc. El costo es determinado por resolución y actualizado para cada vigencia fiscal (Resoluciones No. 689 de 2006 y 065 de 2007).

Para responder a la normatividad vigente, así como a las necesidades de los usuarios y con la responsabilidad de suministrar información válida y confiable en forma oportuna e imparcial, el Laboratorio ha implementando su sistema de gestión de calidad bajo la Norma NTC-ISO/IEC 17025:2005 “Requisitos generales para la competencia de laboratorios de ensayo y calibración” y de esta manera cumplir con los requerimientos de gestión y técnicos exigidos por ésta en términos de organización, competencia del personal, documentación, infraestructura física e instrumental, métodos de análisis y aseguramiento de la calidad.

Debido a ello surge el Programa de Aseguramiento de la Calidad, aprobado anualmente por la Subgerencia de Operaciones y que relaciona tanto la parte técnica como de gestión del laboratorio, incluyendo varias actividades que permiten asegurar la calidad y confiabilidad de los resultados obtenidos a partir de cada análisis.

Dentro de dichas actividades se destaca la participación en Pruebas de Evaluación de Desempeño como las ofrecidas por el IDEAM de forma anual para la evaluación de parámetros ambientales, el programa Interlaboratorio de control de Calidad de agua potable (PICCAP) con tres envíos anuales y los ejercicios Inter e Intralaboratorios de agua potable y residual ofrecidos por la empresa Mollabs.  De igual forma, se destaca el seguimiento al Funcionamiento de los Equipos a través del mantenimiento, verificación y calibración programada en el plan anual, garantizando así la trazabilidad de las mediciones, empleando patrones  certificados, materiales de referencia, facilitando la verificación de las metodologías analíticas a través de la evaluación del grado de conformidad de los métodos empleados para la determinación de los diferentes analitos, basado en la validación estadística de los datos.